Ước tính hiện có khoảng 1.200 tay súng thuộc các nhóm cực đoan vẫn đang hoạt động ngoài vòng pháp luật và tiếp tục phát triển mạng lưới tại một số khu vực ở Indonesia. Những khu vực có nhiều nguy cơ bị tấn công gồm các thành phố ở Java, khu vực phía Nam Sumatra, Bali, và tỉnh Tây Nusa Tenggara.
Trong 5 năm tháng đầu năm nay, cảnh sát Indonesia đã bắt giữ 68 phần tử khủng bố đều là thành viên của nhóm cực đoan Jamaah Ansharut Daulah (JAD). Nhóm này từng âm mưu tấn công khủng bố trong những ngày bất ổn tại thủ đô Jakara sau khi có thông báo kết quả bầu cử vào tháng 5 vừa qua. Indonesia đã cấm JAD hoạt động và tử hình thủ lĩnh nhóm này năm ngoái do chủ mưu các vụ tấn công đẫm máu tại một số thành phố.