Ngay sau đó, Phó Chủ tịch UBND TPHCM Võ Văn Hoan đã Công văn 2155/UBND-NCPC gửi Thanh tra TP, Sở Xây dựng, Sở TN-MT, UBND quận Thủ Đức phối hợp kiểm tra các nội dung liên quan. UBND Quận Thủ Đức cũng có Công văn 2536/UBND-QLĐT phản hồi các nội dung liên quan.
Theo quy hoạch 1/500, khu nhà ở Tân Hải Minh được phê duyệt năm 2007, văn phòng Khu phố 1 đặt tại mặt tiền đường Đào Trinh Nhất và đường D1 (nằm trong dự án). Tuy nhiên, văn phòng Khu phố 1 đã được dời vào công viên (cũng nằm trong dự án) và mọc lên quán cà phê xây dựng sai phép trên khu đất này.
UBND quận Thủ Đức cho biết, ngày 5-11-2002, Kiến trúc sư Trưởng TP ban hành Công văn 3917/KTST-DDB về ý kiến thỏa thuận quy hoạch kiến trúc xây dựng khu nhà ở 9,0944ha tại phường Linh Tây, theo đó vị trí khu đất văn phòng Ban điều hành khu phố cũ được quy hoạch là khu nhà ở, ký hiệu lô L.
Ngày 12-2-2017, Công ty TNHH Sản xuất - Thương mại - Khách sạn Tân Hải Minh có Công văn 17/CV2-2017, đính kèm Bản đồ quy hoạch tổng mặt bằng sử dụng đất tỷ lệ 1/500 khu nhà ở phường Linh Tây có sao y chứng thực của UBND phường Tân Định, quận 1.
Trên cơ sở bản đồ quy hoạch này, phòng ban chuyên môn đã tham mưu UBND quận Thủ Đức qua Công văn 1308/UBND-QLĐT ngày 7-4-2017, trong đó có nội dung thống nhất việc di dời vị trí Ban điều hành khu phố 1 hiện trạng sang vị trí mới thuộc lô số 7.
Song qua rà soát, UBND quận Thủ Đức nhận thấy Bản đồ quy hoạch do Công ty Tân Hải Minh cung cấp thể hiện vị trí Ban điều hành khu phố 1 (ký hiệu số 07), là không đúng với Bản đồ quy hoạch tổng mặt bằng sử dụng đất 1/500 gốc được UBND quận Thủ Đức phê duyệt (không có quy hoạch ban điều hành khu phố).
Tuy nhiên, do Bản đồ quy hoạch này đã được đóng dấu sao y bởi UBND phường Tân Định, quận 1, nên phòng chuyên môn đã chủ quan không kiểm tra đối chiếu so với bản đồ gốc, dẫn đến việc tham mưu UBND quận Thủ Đức ban hành Công văn 1308 mà chưa thực hiện quy trình điều chỉnh quy hoạch.
Nhận thấy qua các đồ án quy hoạch chi tiết xây dựng tỷ lệ 1/500 khu nhà ở phường Linh Tây chưa bố trí vị trí Ban điều hành khu phố để phục vụ nhu cầu sinh hoạt của cộng đồng dân cư (do vị trí cũ đã được thu hồi và quy hoạch thành khu nhà ở), năm 2019 UBND quận Thủ Đức thực hiện các quy trình, thủ tục điều chỉnh cục bộ đồ án quy hoạch chi tiết trên, để bố trí Ban điều hành khu phố vào đồ án quy hoạch theo quy định hiện hành, trên cơ sở vẫn đảm bảo tỷ lệ cây xanh theo quy chuẩn xây dựng Việt Nam 01:2008/BXD quy định tối thiểu 1m2/người.
Hiện UBND quận đã phối hợp các đơn vị, tổ chức lấy ý kiến cộng đồng dân cư về nội dung điều chỉnh quy hoạch này và tiếp tục thực hiện theo quy trình quy định.
Về việc bồi thường và hoán đổi quỹ đất trong dự án, Công ty Tân Hải Minh có 4.432m2 đất bị giải tỏa của dự án xây dựng tuyến nối Tân Sơn Nhất - Bình Lợi - Vành đai ngoài, đoạn qua địa bàn quận Thủ Đức. Năm 2013, Sở Tài chính có văn bản (số 965/STC-BVG ngày 28-1-2013) đề nghị UBND quận Thủ Đức lập hồ sơ bồi thường phần diện tích trên và chi trả tiền bồi thường cho Tân Hải Minh.
Cùng với đó, UBND quận làm việc với Công ty Tân Hải Minh để tiếp nhận 672,96m2 đất nền đã hoàn chỉnh cơ sở hạ tầng kỹ thuật tại dự án khi tiến hành chi trả tiền bồi thường. Theo đó, chính quyền đã chi trả cho Công ty Tân Hải Minh số tiền 3.991.140.000 đồng.
Ngày 5-12-2012 Công ty Tân Hải Minh đã nhận tiền bồi thường. Đối với phần diện tích giao thông 4.206m2 do Nhà nước quản lý, Công ty Tân Hải Minh có nghĩa vụ bồi thường theo tỷ lệ hoán đổi là 672,96m2. Ngày 9-12-2013, Sở Xây dựng có Công văn 10545/SXD-TTBCĐ, báo cáo UBND TP các nội dung liên quan đến công tác tiếp nhận diện tích đất hoán đổi này tại dự án.
Đến ngày 12-2-2014, UBND TP có Công văn 618/UBND-ĐTMT, chấp nhận theo báo cáo nêu trên của Sở Xây dựng. Tuy vậy, đến nay phần đất hoán đổi này Công ty Tân Hải Minh đang quản lý và chưa bàn giao cho UBND quận Thủ Đức. Dù UBND quận đã đôn đốc nhiều lần nhưng công ty vẫn chưa hoàn tất công tác bồi thường, giải phóng mặt bằng (còn 2 hộ dân với diện tích khoảng 2.523,3m2) và hoàn chỉnh hạ tầng kỹ thuật để bàn giao.
Do đó, ngày 12-2-2018, UBND quận Thủ Đức đã có Công văn 782/UBND-GPMB, báo cáo Sở TN-MT về việc thực hiện nghĩa vụ tài chính của Tân Hải Minh để Sở TN-MT xem xét, yêu cầu công ty thực hiện. UBND Thủ Đức sẽ tiếp tục phối hợp với sở ngành TP, kiến nghị xử lý những vi phạm của Công ty Tân Hải Minh.