Vào những năm 1980, khi là nhà nghiên cứu tại Viện Nghiên cứu Sinh học Salk, Malone đã tiến hành nghiên cứu về công nghệ axit ribonucleic truyền tin (mRNA), phát hiện ra rằng có thể chuyển mRNA được bảo vệ bởi liposome vào các tế bào nuôi cấy để báo hiệu thông tin cần thiết cho quá trình sản xuất của protein.
Năm 1987, Malone thực hiện một thí nghiệm mang tính bước ngoặt về việc truyền RNA vào tế bào người, chuột, ếch Xenopus và ruồi giấm.
Vào đầu những năm 1990, ông hợp tác với Jon A. Wolff, Dennis A. Carson và những người khác trong một nghiên cứu lần đầu tiên đề xuất khả năng tổng hợp mRNA trong phòng thí nghiệm để kích hoạt sản xuất protein mong muốn.
Malone tuyên bố là người phát minh ra vắc-xin mRNA, nhưng Wikipedia cho rằng công nhận về điều này "thường được trao cho những tiến bộ sau này của Katalin Karikó hoặc Derrick Rossi, và cuối cùng là kết quả của những đóng góp của hàng trăm nhà nghiên cứu, trong đó Malone chỉ là một".
Tài khoản Twitter của Malone đã có hơn 520.000 người theo dõi. Ông là một nhà phê bình thẳng thắn đối với cả vắc-xin mRNA, cũng như những thất bại nặng nề của các nhà hoạch định chính sách trên toàn thế giới trong việc ứng phó với đại dịch.
Có lẽ vì những chỉ trích của ông, Twitter đã đình chỉ tài khoản của ông mà không đưa ra cảnh bào nào. “Ông không được cảnh báo hoặc tạo cơ hội để xóa bất kỳ dòng tweet vi phạm nào - thay vào đó ông "đơn giản là bị đình chỉ".
Trong tweet cuối cùng của mình, Malone chia sẻ một bài báo tuyên bố rằng vắc-xin Pfizer Covid-19 gây "hại nhiều hơn lợi".