Theo kế hoạch được giao, Sở Xây dựng chủ trì, tổ chức thẩm định dự án, thiết kế triển khai sau thiết kế cơ sở và dự toán xây dựng công trình; đảm bảo tính tổng thể, đồng bộ, khả thi cho toàn dự án; tham mưu, đề xuất giải quyết các khó khăn vướng mắc phát sinh vượt thẩm quyền, trình UBND TPHCM xem xét, quyết định.
Sở GTVT thẩm định thiết kế cơ sở, thiết kế triển khai và dự toán xây dựng công trình. Sở KH-ĐT thực hiện công tác đấu thầu đối với các nội dung công việc liên quan của dự án; phối hợp Sở Tài chính và các đơn vị liên quan bố trí vốn. Sở TN-MT phối hợp với các sở ngành và đơn vị liên quan thực hiện các thủ tục công tác thu hồi đất, bàn giao mặt bằng cho chủ đầu tư theo đúng kế hoạch đề ra; hướng dẫn và giải quyết các vướng mắc trong công tác bồi thường, hỗ trợ và tái định cư của dự án.
Sở QH-KT phối hợp các sở ngành và đơn vị liên quan cập nhật, điều chỉnh các đồ án quy hoạch phân khu có liên quan; hướng dẫn, hỗ trợ chủ đầu tư trong quá trình thực hiện dự án đối với các lĩnh vực liên quan đến quy hoạch, điều chỉnh quy hoạch.
Ban Quản lý dự án Đầu tư xây dựng các công trình dân dụng và công nghiệp chịu trách nhiệm toàn diện trước UBND thành phố về tổ chức điều hành, quản lý dự án, đảm bảo tiến độ, chất lượng, mỹ thuật công trình theo yêu cầu. UBND quận Bình Thạnh và Gò Vấp hoàn thành công tác bồi thường, hỗ trợ, tái định cư và bàn giao mặt bằng cho chủ đầu tư theo đúng tiến độ; góp ý thiết kế triển khai sau thiết kế cơ sở và dự toán xây dựng công trình thuộc chức năng quản lý trên địa bàn…
Dự án nạo vét, cải tạo môi trường, xây dựng hạ tầng rạch Xuyên Tâm có tổng mức đầu tư hơn 9.664 tỷ đồng, ảnh hưởng 1.782 hộ gia đình, cá nhân và 14 cơ quan. Trong đó, chi phí đền bù, giải phóng mặt bằng hơn 6.600 tỷ đồng; hơn 3.000 tỷ đồng phục vụ cho các gói thầu xây lắp với chiều dài 6,6km và 3 tuyến rạch nhánh (cầu Sơn, Bình Lợi, Bình Triệu) có chiều dài hơn 2,2km. Việc triển khai dự án sẽ giải quyết vấn đề ô nhiễm môi trường tại rạch Xuyên Tâm; thoát nước, chống ngập cho khu vực; kết nối giao thông cục bộ và xây dựng hạ tầng kỹ thuật đồng bộ dọc tuyến; thu gom rác thải về nhà máy xử lý tập trung của thành phố.