Đồng thời, tổ chức giải tỏa, thanh thải vật cản, chướng ngại vật lấn chiếm bãi sông, lòng sông; thực hiện nạo vét, khơi thông dòng chảy, bảo đảm khả năng tiêu, thoát lũ.
UBND TPHCM giao Sở Xây dựng chủ trì, phối hợp các đơn vị liên quan tổ chức kiểm tra, rà soát việc vận hành hệ thống thoát nước đô thị, công trình bơm tiêu (đặc biệt trong thời gian có lũ), bảo đảm tuân thủ quy trình vận hành được cấp có thẩm quyền phê duyệt và yêu cầu an toàn chống lũ.
Sở Xây dựng cũng chủ trì, phối hợp Sở Nông nghiệp và Môi trường, UBND các phường, xã, đặc khu tiến hành kiểm tra, quản lý trật tự xây dựng tại khu vực bãi sông, lòng sông thuộc phạm vi quản lý, bảo đảm không ảnh hưởng đến không gian thoát lũ và an toàn đê, kè.
UBND TPHCM cũng chỉ đạo các đơn vị quản lý, khai thác công trình thủy lợi, thoát nước của thành phố thường xuyên kiểm tra, rà soát quy trình vận hành bơm tiêu, vận hành cống qua đê (nhất là thời gian xảy ra mưa lớn, triều cường, xả lũ); chỉ vận hành bơm tiêu cưỡng bức ra sông theo quy trình vận hành được cấp có thẩm quyền phê duyệt, đồng thời bảo đảm an toàn công trình và an toàn chống lũ cho hệ thống đê, kè.
Bên cạnh đó, các đơn vị phải thường xuyên nạo vét các bãi bồi tự nhiên hoặc nhân tạo gây cản trở dòng chảy; tháo dỡ các cầu tạm, bến bãi bốc xếp hàng hóa không phép hoặc nằm trong hành lang thoát lũ; phát quang cây cối rậm rạp trên bãi sông làm gia tăng lực cản dòng chảy.
