Theo dự thảo, thuế suất ưu đãi 10% trong 15 năm được áp dụng với thu nhập từ một số dự án đầu tư mới thuộc ngành, lĩnh vực ưu đãi hoặc tại địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội khó khăn, đặc biệt khó khăn, bao gồm khu công nghệ cao, khu nông nghiệp công nghệ cao, khu công nghệ số tập trung và các khu kinh tế trong vùng ưu đãi thuế.
Mức thuế suất 10% cũng áp dụng không thời hạn với một số trường hợp như doanh nghiệp hoạt động trong ngành nghề ưu đãi tại địa bàn ưu đãi thuế; nhà xuất bản, hợp tác xã, liên hiệp hợp tác xã theo quy định; cơ quan báo chí thực hiện nhiệm vụ ngành nghề ưu đãi.

Dự thảo quy định thuế suất 15% áp dụng với thu nhập từ hoạt động thuộc một số ngành nghề nhất định, nhưng không thuộc địa bàn ưu đãi thuế.
Đối với các dự án đầu tư mới trong lĩnh vực ưu tiên, thực hiện tại khu kinh tế hoặc địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội khó khăn (không thuộc địa bàn ưu đãi đặc biệt), thuế suất ưu đãi 17% được áp dụng trong 10 năm. Một số hoạt động khác được hưởng thuế suất 17% không giới hạn thời gian.
Đáng chú ý, trong dự thảo cũng cho phép Thủ tướng xem xét kéo dài thời gian áp dụng thuế suất ưu đãi tối đa không quá 15 năm đối với các dự án có quy mô đầu tư lớn, có ảnh hưởng quan trọng đến phát triển kinh tế - xã hội. Cụ thể gồm: dự án đầu tư mới có vốn từ 6.000 tỷ đồng trở lên; sản xuất sản phẩm có khả năng cạnh tranh toàn cầu với doanh thu từ 20.000 tỷ đồng/năm trong 5 năm liên tiếp; sử dụng thường xuyên từ 6.000 lao động trở lên; hoặc đầu tư hạ tầng kinh tế kỹ thuật thiết yếu.
Đối với các dự án đặc biệt trong lĩnh vực công nghệ cao, Chính phủ có thể quyết định áp dụng mức thuế suất ưu đãi giảm tới 50% so với thuế suất thông thường, với thời gian ưu đãi không quá 1,5 lần thời gian ưu đãi ban đầu và có thể kéo dài, nhưng tổng thời gian không vượt quá thời hạn của dự án.
Dự thảo quy định thời điểm bắt đầu tính thuế suất ưu đãi là từ năm đầu tiên doanh nghiệp có doanh thu từ dự án đầu tư mới. Trường hợp doanh nghiệp được cấp giấy chứng nhận công nghệ cao, nông nghiệp công nghệ cao, khoa học công nghệ hoặc ưu đãi công nghiệp hỗ trợ sau khi phát sinh doanh thu, thời gian ưu đãi sẽ được tính lại từ năm cấp giấy chứng nhận.
Cùng với các mức thuế suất ưu đãi, dự thảo nghị định hướng dẫn thi hành Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp cũng quy định chi tiết về miễn, giảm thuế thu nhập doanh nghiệp nhằm khuyến khích đầu tư mới, mở rộng sản xuất và phát triển các ngành, lĩnh vực ưu tiên.